2016年1月18日，由丁香园自建运营的杭州丁香诊所正式营业。自2015年4月开始启动的丁香诊所，经过八个月的筹备和近一个月的试营业，目前已经全面开放预约问诊。
丁香诊所是以美国全科医疗体系为基础，为患者提供常见病诊疗、慢病管理的全科诊所。诊所聘请的全职医生均来自三甲医院，拥有五年以上工作经验，并经过严格筛选与培训，拥有丰富的临床经验。诊所采取诊金制，患者对于医生服务质量的评价与反馈将与医生绩效收入挂钩。
与公立医院承担的医疗功能不同，丁香诊所主要针对常见病、慢病患者，为患者提供更有效率、更标准化、更有品质的就医服务。通过诊所动线设计与布局配合，使得问诊、检查、取药等环节都能在诊室内完成，节省患者时间成本，缩短就医路径。
同时，丁香诊所通过自主研发的诊所管理系统，深度整合微信沟通管理平台，将诊前预约与诊后随访的效率大大提高，并将利用智能可穿戴设备对慢病患者的各项评测指标进行远程管理。目前丁香诊所已经与上海医药集团、金域、迪安等合作伙伴达成战略合作，支持第三方药品配送以及第三方检验。
丁香诊所致力于帮助大众培养个人健康管理意识，并对各个阶段的患者进行主动的平衡干预，提高患者、家庭及社区的整体健康水平，为公共医疗资源提供有益补充。