作为腾讯的创始人之一，马化腾在2007年推动腾讯成立了中国第一家互联网企业的公益慈善基金会，并开展跟其他公益组织互动合作，而腾讯基金会搭建的腾讯公益平台，已经成长为国内最大的互联网公益平台之一。多年来，马化腾一直积极从事公益事业建设，参与了不同领域的项目，包括儿童医疗，抗灾抢险和环境保护等。他身兼中国爱佑慈善基金会副理事长，也是新成立公募基金会爱佑未来的出资发起人之一，以及壹基金理事。同时，马化腾为大自然保护协会（The Nature Conservancy）中国理事, 去年更携手国内热心公益的企业家共同发起成立桃花源生态保护基金会，并担任联席主席。
马化腾表示: “通过十年的公益实践和探索，日益感到需要一个更长远、更高效的系统规划和架构，以善用财富回馈社会。同时通过专业团队提升公益活动的管理效率，我本人也可以投入更多精力到腾讯的战略、产品体验，以及更长远的公益规划。”
公益慈善基金未来投入的项目将主要用于中国内地，并根据实际需要在国内设立具体执行项目的基金会，按专业团队的评估建议去捐助合适的公益慈善组织和项目。